Installer libdca-utils et mkvtoolnix.

sudo apt-get install mkvtoolnix libdca-utils

Ensuite, la commande mkvinfo permet de connaitre la piste à extraire.

mkvinfo mavideo.mkv

Ici, la piste audio en DTS est la piste 3.

| + A track
|  + Track number: 3
|  + Track UID: 2195880849
|  + Track type: audio
|  + Codec ID: A_DTS
|  + Codec decode all: 1
|  + Language: fre
|  + Name: DTS 1509 Kbps
|  + Audio track
|   + Sampling frequency: 48000
|   + Channels: 6

Extraire la piste audio DTS avec la commande mkvextract.

 mkvextract tracks mavideo.mkv 3:audio.dts

Ensuite la convertir en AC3 avec la commande dcadec.

dcadec -o wavall audio.dts | aften - audio.ac3

Et pour finir, il faut intégrer la piste AC3 dans le mkv avec la commande mkvmerge.

mkvmerge -o mavideoac3.mkv -A mavideo.mkv audio.ac3